京橋のバイオインフォマティシャンの日常

南国のビーチパラソルの下で、Rプログラムを打ってる日常を求めて、、

fasterq-dump

【SRA Toolkitの続編】Mac版のSRA Toolkitを設定して、fastq-dumpの高速版「fasterq-dump」を試してみた件

SRA Toolkitの設定 SRA Toolkitの設定は、以前の記事を参考のこと。 skume.net Mac版のSRA Toolkitを設定すれば、 そのままの設定で、fasterq-dumpコマンドも実行できる。 fasterq-dumpコマンドで、FASTQファイルを高速に取得する SRA toolsの2.9.1リリース…