NCBI
(adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({}); SRA Toolkitの設定 SRA Toolkitの設定は、以前の記事を参考のこと。 skume.net Mac版のSRA Toolkitを設定すれば、 そのままの設定で、fasterq-dumpコマンドも実行できる。 fasterq-dumpコマンドで、FAST…
NCBI
シークエンスデータの取得
NGSデータ
SRA Toolkit
fastq-dump
vdb-config
SRA
Terminalコマンド - wget
Terminalコマンド - open
Terminalコマンド - echo
パス設定
FASTQ形式
FASTA形式
R - バイオインフォ
FASTQファイル
(adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({}); はじめに - SRA Toolkitについて - SRA Toolkitは、NCBIのデータベースである、Sequence Read Archivesのデータを扱うためのツール群である。 もっと簡単に言うと、コマンドラインでシークエンス・デー…
