NCBI
SRA Toolkitの設定 SRA Toolkitの設定は、以前の記事を参考のこと。 skume.net Mac版のSRA Toolkitを設定すれば、 そのままの設定で、fasterq-dumpコマンドも実行できる。 fasterq-dumpコマンドで、FASTQファイルを高速に取得する SRA toolsの2.9.1リリース…
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シークエンスデータの取得
NGSデータ
SRA Toolkit
fastq-dump
vdb-config
SRA
Terminalコマンド - wget
Terminalコマンド - open
Terminalコマンド - echo
パス設定
FASTQ形式
FASTA形式
R - バイオインフォ
FASTQファイル
はじめに - SRA Toolkitについて - SRA Toolkitは、NCBIのデータベースである、Sequence Read Archivesのデータを扱うためのツール群である。 もっと簡単に言うと、コマンドラインでシークエンス・データを取得・処理するための、入れておくと便利なツール群…
