はじめに R言語をやる目的は何か？ 何を学ぶか？ ゼロから何を学べばよいか？ 最低限、R言語の何を学べば、実践に移行できるのか？ まとめ はじめに 人類がこれまでに作成した文書の総量を正確に計測することは非常に困難です。しかし、間違いなく、過去から…
この記事の音声読み上げ はじめに プレインストールの設定 open-interpreterのインストールと設定 Open-interpreterの使用 まとめ M1 Macでstream resultが制御できないバグについて 補足: interpreter -yでの実行時の表示 補足: Code-Llamaに進んだ場合のメ…
はじめに GitHubアカウント側での設定 RStudio daily版のインストール RStudio上でのGlobal options設定 まとめ 参考記事 はじめに 最近の生成AIの勢いはとどまることを知らず、データ分析やプログラミング時の面倒な作業の大半がAIで解決されつつあります。…
はじめに - HDDとSSDの重要性と用途 HDDとSSDの基本的な違い SSDの選び方 HDDとSSDの組み合わせ方 商品紹介セクション - HDD 人気ランキング バッファロー 外付けハードディスク 4TB HD-AD4U3 UnionSine 外付けハードディスク超薄型外付けHDDポータブルハー…
2023年7月版 LLM情報アップデート 2023年7月版 LLM情報アップデート speakerdeck.com ChatGPTの現状理解 ChatGPT とは？ 前回の振り返り ChatGTP界隈の1ヶ月間のアップデート (2023年7月版) Rパッケージ開発にLLMをどう活用するか？の整理 GPTが使えるRパッ…
はじめに 実行環境 txt2img実行関数の読み込み・API keyの設定 generateImage4R関数で、画像生成を実行した 自作したプロンプトで画像生成 GPT-4で作成したプロンプトで画像生成 photorealisticプラグイン + GPT-4による最適化で作成したプロンプトで画像生…
はじめに 初心者でも分かりやすいように、R言語のパッケージ開発の手順を聞いてみた パッケージの構築デザインを考える際の注意点は？？？ CRANにパッケージを投稿・登録する際に、留意点は？？？ CRAN以外にRパッケージを投稿できるリポジトリは？？？ 中級…
はじめに chat4R 関数の詳細とその可視化 R関数にroxygen2形式の説明を付与する R関数のダイアグラムを作成する ChatGPTのプラグイン設定 chat4R関数の実行プロセスをMermaidで表現したダイアグラム まとめ 補足: R関数の可視化で使用したプロンプト(命令分)…
BioPackathon 2023 #6: ChatGPTとLarge Language Models（LLM）の現状と最新情報 はじめに ChatGPTとは？ iOS版ChatGPTアプリのリリース ウェブ情報の取得とプラグイン ChatGPTの限界 日本初のChatGPTプラグイン: 食べログ プロンプトエンジニアリング Magic…
先日5月17日に、研究会でトークしたスライドです。 speakerdeck.com ChatGPTの現状理解 OpenAI社について ChatGPTとは？ GPT-3.5とGPT-4 フロンプトとは？ ChatGPTの得意なこと・苦手なこと（事例とTipsも） R関数&パッケージ作成への活用 GPT API keyの取得…
はじめに 実行環境 まずは、ファイルを圧縮する 解凍せずに、zipファイルに含まれるファイル一覧を表示する 解凍せずに、gzファイルの中身を閲覧する 解凍せずに、gzファイルの中身を部分的に閲覧する まとめ 参考資料 はじめに Linux/Mac環境では圧縮された…
はじめに 実行環境 dfコマンドの実行例 duコマンドの実行例 まとめ はじめに dfとduという、2つのコマンドを紹介します。 ハードディスクの容量監視をする上で、重要なコマンドなので、ぜひ知っておこう。 dfコマンドはディスクの空き領域を知るコマンド、 …
はじめに lsコマンドで、現在のパーミッション設定を表示する ファイルのアクセス権限の見方について 全てのユーザーに実行権限(a+x)を追加する 他ユーザーの実行権限(o-x)を削除する 3つの数字列で、アクセス権限を与える ディレクトリ下のすべてのフォルダ…
はじめに 関連パッケージ BTCの月足データの平均足チャートを作成する 月足データのストキャスティクスRSIオシレーター BTCの週足データの平均足チャートを作成する BTCの日足データの平均足チャートを作成する dygraphsで複数のローソクチャートを描く まと…
はじめに 実行環境 パッケージ準備 1次元ランダムウォーク 2次元ランダムウォーク: 2方向移動 2次元ランダムウォーク: 全方向移動 ランダムウォークで画像表示のアニメーションを作成してみると、こうなる。 twitterから収集した画像を使ってみたら、こうな…
はじめに 解析解と数値解 今回扱う反応式の事例 実行環境 パッケージ準備 一次反応モデルの数値解析 animationパッケージでモーションチャート作成 ggplot2でモーションチャート作成 plot_lyでモーションチャート作成 逐次反応モデルの数値解析 逐次反応モデ…
はじめに 関連記事 実行環境 パッケージ準備 SP100銘柄のデータ取得 plotlyによるモーションチャート(motion chart)の作図 dygraphsによるインタラクティブな作図 まとめ 補足 plotlyによるインタラクティブチャート + ハイライト ggplotlyによるインタラク…
はじめに 実行環境 Rパッケージの読み込み heatmap3パッケージを用いた、ハイカラなヒートマップ表現 heatmap3でのヒートマップ作成（1）シンプルなヒートマップ heatmap3でのヒートマップ作成（2）少し複雑なヒートマップ heatmaplyパッケージを使った、ヒ…
はじめに 実行環境 Rパッケージの準備 ダウ平均銘柄のデータ取得 ダウ平均銘柄でのバー・チャート・レース ダウ平均銘柄のバー・チャート・レース作成 まとめ 関連記事 Rコード: getDJIA.R はじめに いま。。このブログは、「アニメーショングラフ」推しです…
はじめに 実行環境 Rパッケージの読み込み Open-Babel & PyMolのインストールについて Open-Babelの基本動作 Open-Babelの関連コマンドについて PubChemからの化合物の情報・構造データの取得 Rで、PubChem化合物データを読み込み 「gluc」あるいは「glyc」…
はじめに R-CRANからのR言語アプリのインストール 「r」でgoogle検索すると。。。 「CRAN」でgoogle検索すると。。。 MacOSでpkgを実行して、Rをインストールする Mac Homebrewで、R言語をインストールする posit HPから、RStudioをインストールする Mac Hom…
はじめに 実行環境 Rパッケージの準備 日経225銘柄のデータ取得 日経225銘柄でのバー・チャート・レース 日経225 上位20銘柄でのバー・チャート・レース作成 日経225 下位20銘柄でのバー・チャート・レース作成 まとめ 参考資料 Rコード: getNikkei225.R は…
はじめに 実行環境 テストデータのダウンロード 関連記事 Javaの設定: スキップ可です fastqcの使い方 Fastqcのインストール Fastqcの基本動作 Fastqcの実行 fastqcレポートの見方 fastqcの原著 MultiQCの使い方 MultiQCのインストール MultiQCの実行 MultiQ…
はじめに 実行環境 Prophetのデータフォーマット 関連パッケージの準備 ブログ利用ユーザー数の推移を未来予測する 過去14日間の訪問ユーザー数(y_14day列)を使って、ブログ利用ユーザー数の推移を予測する 他のプロット方法について 過去28日間の訪問ユーザ…
はじめに パッケージ準備 ビットコインの長期チャートデータについて 長期の移動平均から、BTCの経験的な底値が分かるかも？？ 長期の加重移動平均線(WMA)から、BTCの経験的な底値が分かるかも WMAの長期トレンドを網掛け(ポリゴン)表示について SMAの長期ト…
はじめに とあるディレクトリとファイル構成について まずは、filesstringsパッケージをインストールする ファイルを移動させる関数群 同時に、N個のものを移動させる場合 まとめ 参考資料 はじめに 過去に、R環境から行う、 フォルダの基本操作（作成・削除…
Introduction Biological morphome Morphomics The above illustration is reprinted from : Omics - Wikipedia Introduction Biological tissues contain countless amounts of extremely fine and complex morphological information. In order to underst…
About grep command Processing of text in files Show lines with a certain string Show lines without the certain string Output lines without a certain string as an alias file Delete blank lines Count the number of lines in a file Searching f…
はじめに、低糖質ダイエットとは？ 糖質を食べると、どうなる？ 摂取した糖質はどう利用されるか？ マルターゼは、α-グルコシダーゼと呼ばれる 薬剤化合物の探索とα-グルコシダーゼの阻害剤について アカルボースについて 編集後記 はじめに、低糖質ダイエッ…
はじめに seqinrパッケージのインストール Biostringsパッケージのインストール seqinr::read.fastaを使って、HIV-1 全ゲノムのFASTAファイルの読み込み場合 seqinr::read.fastaを使って、FASTAを「ベクトル」として読み込む seqinr::read.fastaを使って、FA…
