M1 Mac
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R言語
Terminalコマンド - wget
Terminalコマンド - brew
R - download.file
NCBI
NCBI - RefSeq
RefSeq FTP
リファレンンスゲノム
FASTA形式
NCBI - E-utilities
はじめに NCBI RefSeqのFTPサイトについて NCBIのE-utilitiesサービスを使った、RefSeqのダウンロード方法について 枯草菌（Bacillus subtilis）のRefSeqのダウンロード実行について 枯草菌について Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 complete ge…
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flash2
ペアエンドリード
FASTQ形式
FASTQファイル
シーケンスデータ
シークエンスデータの取得
NGSデータ
Terminalコマンド - wget
Terminalコマンド - echo
Terminalコマンド - gzip
zsh - バイオインフォ
zsh - make
Mac - 環境構築
NGS - リードマージ
はじめに FLASHの原著論文 今回のzsh実行環境 M1 Macにおけるflash2のインストール flash2によるペアエンドfastqのマージ実行 GAGEからペアエンドのfastqデータを取得する まとめ ゲノム解析の関連記事 参考資料 補足 FASTQ形式からFASTA形式への変換 - sed…
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ドッキング
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ドッキング・シミュレーション
分子シミュレーション
AutoDock
AutoDock Vina
Terminalコマンド - wget
Terminalコマンド - chmod
brew - boost
LigPlot+
Mac - PyMOL
brew - pymol
mov-gif
はじめに - AutoDock Vina 原著論文 - AutoDock Vina - 今回やること セットアップ brewの設定 brewコマンドを用いたパッケージのセットアップ Autodock Vina 1.2.2のセットアップ AutoDock Vinaのチュートリアル「basic_docking」を実行してみる 実行時のコ…
