京橋のバイオインフォマティシャンの日常

南国のビーチパラソルの下で、Rプログラムを打ってる日常を求めて、、

ペアエンドリード

M1 Mac環境で、flash2を使ってペアエンドfastqをマージしてみた件

はじめに この記事では、flash2を使った、ペアエンド・リードのマージとその他諸設定について紹介します。 flash2のもともとのアルゴリズムは、「FLASH (Fast Length Adjustment of SHort reads) 」と言われるものです。 名前からも推測できる通り、flash2は…