R言語
はじめに NCBI RefSeqのFTPサイトについて NCBIのE-utilitiesサービスを使った、RefSeqのダウンロード方法について 枯草菌（Bacillus subtilis）のRefSeqのダウンロード実行について 枯草菌について Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 complete ge…
Rで顔認識をやってみた話 顔認識の関連パッケージをセットアップする 男性画像に対する顔認識の検証 顔認識後に、顔部分をクロップ(切り出す)する 女性の画像を用いた顔認識の検証実験 まとめ 参考 - 顔認識 Rで顔認識をやってみた話 ふと思い立って調べてみ…
はじめに tesseract::ocr関数を使った、画像からの文字起こし OCR関連パッケージのセットアップ 文字認識して、英語を抽出する場合: 英文字のみ 文字認識して、日本語を抽出する場合: その1 日本語文字のみ 文字認識して、日本語を抽出する場合: その2 日本…
2007年9月-と2021年12月-の2つの GSPCプロットの重ね合わせ（2022年9月19日アップデート） Rコード: 2つのGSPCプロットの重ね合わせ 年初より続く、S&P500指数の下落はかなり稀だった件 消費者物価指数（CPI）についての注釈 1970-1971年のS&P500指数のチャ…
はじめに オープンデータの関連記事 アメリカ地質調査所、および同研究所が提供する世界で発生した地震データのスプレッドシート 過去1日地震データのスプレッドシートURL 過去7日地震データのスプレッドシート 過去30日地震データのスプレッドシート leafle…
はじめに: 『R環境で小説のテキストマイニング』の連載シリーズ 連載シリーズの目次 まずは、実行環境 形態素のワードクラウドに関するイントロダクション RMeCab形態素解析済みの結果の読み込み .Rdsをロードする場合 .txtをロードする場合 ワードクラウド…
この記事は、2020年6月13日記事のアップデート版です。 はじめに 方法 (1): １０倍量ヨーグルト作製のマテリアル 方法 (2): １０倍量ヨーグルトの作製プロトコール 結果: 種菌の増殖曲線の検討 まとめ 参考文献 はじめに 最近、ヨーグルト作りにハマっていま…
はじめに: 『R環境で小説のテキストマイニング』の連載シリーズです。 連載シリーズの目次 実行環境 名詞、接頭辞、接尾辞をくっつける、品詞のルールベースの複合語抽出 pytermextractを使った複合語抽出 ターミナル環境上での、pytermextractを使った複合…
はじめに: 『R環境で小説のテキストマイニング』の連載シリーズです。 連載シリーズの目次 実行環境 形態素解析と辞書設定 mecabを使った形態素解析 MeCabの辞書設定 辞書による形態素解析結果の違い デフォルトのipadic辞書を使った場合 neologd辞書を使っ…
はじめに 連載シリーズの目次 実行環境 1. 青空文庫、対象小説の紹介 夏目 漱石が執筆した小説の無料公開リスト 2. 「坊っちゃん」のテキストの前処理 処理したテキストの保存 まとめ テキスト処理の関連記事 参考資料 はじめに テキストマイニングは、簡単…
はじめに パーマー群島（南極大陸）のペンギンさんのデータを活用する hclust関数での階層的クラスタリング ウォード法(ward.D)を使用する場合 ウォードD2法(ward.D2)を使用する場合 最近隣法(single)を使用する場合 群平均法(average)を使用する場合 McQuit…
はじめに rtweetパッケージのインストール テキストをつぶやく 画像をつぶやく まとめ 補足 全てのフレンドのフォローを辞めるTips 闇を消そう、、Twitterのポストを全削除するTips 闇からの開放企画（v2）: ユーザーが行った「いいね」をすべて削除するTips…
エクセルデータをクリップボードにコピーしてR環境に読み込む コピーしたセルがヘッダーを含む場合 コピーしたセルがヘッダーを含まない場合 追記（2020年6月10日）: マークダウンなどでテーブル出力 【Rのジミ〜な小技シリーズ】 参考資料 エクセルデータを…
はじめに NASDAQ-100のWikipediaページ、Rでの下準備 NASDAQ-100 使用するパッケージの事前準備 Wikipediaページからの銘柄リストの取得 NASDAQ-100 NASDAQ-100銘柄の年間パフォーマンスをアニメーションにする 1年間のパフォーマンス ツリーマップのアニメ…
特定パッケージだけを削除する方法 R環境での実行例 補足: 他の関数群 特定パッケージだけを削除する方法 Rのデフォルトパッケージを残して、 追加でインストールしたパッケージだけを削除する方法をメモしておく。 パッケージがいろいろと増えてくると、 パ…
はじめに R言語のおすすめ入門本 5 選 + アルファを紹介！！ 改訂2版 RユーザのためのRStudio[実践]入門〜tidyverseによるモダンな分析フローの世界 R言語ではじめるプログラミングとデータ分析 Rでらくらくデータ分析入門 ~効率的なデータ加工のための基礎…
はじめに 関連パッケージの読み込み SRA Toolkit / fastq-dump コマンドを使って、FASTQファイルを取得する。 FASTQファイルの読み込み リード長を取り出す方法 クオリティスコアを可視化する サイクルごとにクオリティスコアを可視化する まとめ ゲノム解析…
はじめに 関連パッケージのインストール・ロード ministデータセットをダウンロードする 7のみのデータを抽出して、アレイ形式に変換してノーマライズする 生成器モデル (1) Generatorモデル (生成器モデル)の作成(1) Discriminatorモデル (識別器モデル)の…
画像アレイデータを提供するexperimentHubパッケージ BioImageDbsのインストール BioImageDbsのデータセット表示 画像アレイデータのダウンロード (1) EM_id0001_Brain_CA1_hippocampus_region (2) LM_id0001_DIC_C2DH_HeLa 画像アレイデータを提供するexper…
序章 関連パッケージのインストール ひまわり画像をwikipediaからダウンロードして表示する Imageクラスを「行列」に変換する RGB成分を3D表示する ヒマワリ画像を64x64ピクセルでクロップ（分割）する 主成分分析(PCA)、累積寄与率の計算と可視化 PCA結果の…
はじめに パッケージのインストール ひまわり画像をwikipediaからダウンロードして表示する RGB画像をヒストグラムで表示する グレー画像をヒストグラムで表示する RGB画像を各成分に分離して、各画像を表示する フィルターを変えて、画像の縮小を行い、結果…
はじめに rtweetの諸設定から もし「Error in default_cached_auth():」がでた時の対処 米国株をクエリに呟きを検索してみる。 つぶやきの形態素解析 単語感情極性対応表を使った感情分析 全つぶやきで、感情分析してみる。 まとめ 補足 M1 Macでのmecabのイ…
はじめに データセット一覧 Documentation for package ‘datasets’ version 4.1.0 参考資料 【Rのジミ〜な小技シリーズ】 R言語 入門について関連図書 RStudio 入門書 はじめに 2021年４月現在、R言語で使用できるデータセット一覧をまとめてみた。 概要の和…
