京橋のバイオインフォマティシャンの日常

データ分析、コマンドライン、プログラミングについての技術資料・自己アップデート・悩み事などをまとめています。現在、DL勉強中。

R - 大規模ネットワーク

【R・ビッグデータ解析の処方箋】Rで、10万ノードを超える大きなネットワーク図を描画するTips 〜 igraph::plot.igraphは使い物にならない件 〜

Rでのネットワーク図の作成では、igraph packageがよく使われる。 ただ、igraphによるネットワーク図の描写は、1万ノードを超えたあたりから、結構な時間がかかる。 そのため、10万ノードを超えるような、大規模なネットワーク図の描画には、ちょっとした…