京橋のバイオインフォマティシャンの日常

南国のビーチパラソルの下で、Rプログラムを打ってる日常を求めて、、

Terminalコマンド - grep

grepコマンドで文字列処理をやってみた件【その2】検索語のヒット数カウントとか検索語の前後文字の抽出とか色々

はじめに 「grepコマンドによる文字列処理をやってみた」の続編です。 以前扱えていなかった内容をやっていきたいです。 grepコマンドの基本については過去の記事を参照のこと。 skume.hatenablog.com まずは、サンプルデータをダウンロードする $ svn expor…

grepコマンドで文字列処理をやってみた件【その1】ファイル内のテキストに対する処理とか

はじめに grepコマンドは、ある特定の文字列を含むものを取り出す・検索するときに使用します。 大別して、ファイル内のテキストに対してgrepを行うか、ファイル名に対してgrepを行うかでやり方が変わってきます。 やってることは単純だが、いろいろと応用で…

【LINUX/Macの基本コマンド①】 システム情報、CPU情報、メモリ情報を表示してみる

このコーナーでは、CentOSで使う、基本的なコマンドラインをまとめてみることにする。 第1回目として、ターミナルコマンドで、 システム情報、CPU情報、メモリ情報を表示するやり方について、 以下に示す。 システム情報 # システム情報の表示 # -a: コンピ…

grepコマンド で基本的なテキスト処理をまとめてみた件

はじめに grep コマンドは、AppleのHPにファイル内の文字列を探すツールであると説明されているが、 grep コマンドを知ると、単に「文字列を探す」だけでなく、 いろいろな応用的な操作ができるようになる。 この記事では、Mac版 grepコマンド の基本的なテ…