京橋のバイオインフォマティシャンの日常

南国のビーチパラソルの下で、Rプログラムを打ってる日常を求めて、、Daily Life of Bioinformatician in Kyobashi of Osaka

R - tidyverse

RでODE(常微分方程式)【R言語/ODEを用いて生化学の主要反応速度論モデルを数値的に解いてみたの巻】

はじめに 解析解と数値解 今回扱う反応式の事例 実行環境 パッケージ準備 一次反応モデルの数値解析 animationパッケージでモーションチャート作成 ggplot2でモーションチャート作成 plot_lyでモーションチャート作成 逐次反応モデルの数値解析 逐次反応モデ…

R言語におけるデータのテーブル表示: knitr & mmtable2とかの紹介

はじめに パッケージのインストール knitr::kableを用いた実行例 mmtable2を用いた実行例 参考資料 はじめに knitrパッケージは、R言語による動的レポート生成のための汎用パッケージであって、Literate Programmingの手法を用いたRでの動的なレポート生成の…