Bioconductor
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R言語
Bioconductor
R - Bioconductor
FASTQ形式
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ShortRead - readFastq
SRA Toolkit
fastq-dump
シークエンスデータの取得
シークエンスデータ解析
R - バイオインフォ
FASTQファイル
(adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({}); はじめに 今回は、MacOSX環境で、SRA Toolkitのfastq-dumpを用いて取得した、 FASTQ形式ファイルをRに読み込む方法を扱う。 FASTQ形式ファイルの読み込みには、 Bioconductorパッケージの1つである、 Sh…
Amazon Web Services（AWS）とは、 Amazon.comにより提供されているクラウドコンピューティングサービスである。 今回、AWSサービスを管理するための統合ツールである、 AWS CLIのインストールとかセットアップについてまとめてみた。 まずは、ターミナルを…
R言語
Bioconductor
ExperimentHub
ExperimentHub - query
BioImageDbs
深層学習
画像アレイデータ
画像アニメーション
magick
magick - image_read
BioImageDbsパッケージは、Rで可読なフォーマット(.Rds)で、 深層学習(DL)用の画像アレイデータ(4次元あるいは5次元)を 提供するexperimentHubパッケージである。 BioImageDbsパッケージ BioImageDbs概要(英語) 今回、BioImageDbsパッケージの使用方法を解説…
Mac - R
Bioconductor
RNA-seq解析
R - Bioconductor
R - RNAseq123
R - limma
R - Glimma
R - edgeR
R - Mus.musculus
R - 数式表現
RNA-seq解析チュートリアル
R - シークエンス解析
R - RNA sequence 解析
R - RNA解析
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