公共（バイオ）画像データのリポジトリをまとめてみた

まとめページ画像データセット画像リポジトリ R - Bioconductor Kaggle Deep learning バーチャルスライド画像

ライフサイエンス・基礎生物、医療・医用などの画像データを中心に、機械学習・深層学習に使えそうな、データセット関連のページリンクをまとめてみた。【24 June 2021, updated】随時更新予定 Dataset Search - Google Dataset Search 「segmentation」で…

2020-12-16

画像解析関連のRパッケージについて調査してみた件〜ANTsRNetを用いた、RにおけるU-NETの実装事例〜

Deep Learning Mac R R - Keras R - TensorFlow R - ANTsRNet Terminalコマンド - git 画像解析 - Segmentation R - U-NET segmentation

今回、画像処理・画像解析に関するRパッケージを調査したので、見つかったパッケージを（広く浅く）紹介する。調査対象は、CRAN、Bioconductor、Neuroconductor (= GitHub/CRAN) とかで、検索キーワードは、imag(e), microscop(y) あたりで調べた。あと、…

Paperswithcode.com（主にDLモデル・コード、論文、コンペのスコアとかのまとめサイト）にあるComputer-Visionセクションのまとめをしてみた件

Deep Learning Papers with Code データサイエンス画像解析画像認識

Papers with Codeというサイトがある。そのサイトのAboutを見てみると、 Our mission Papers with Codeのミッションは、機械学習の論文、コード、評価表を含む無料でオープンなリソースを作成することです。これは、NLPとMLに支えられたコミュニティと一緒…

R/Keras/TensorFlowでやる『ディープラーニング(Deep Learning)』のすゝめ【その２】教師なしニューラルネットワーク Autoencoder with 2D CNNの実装、そして色ムラ・ノイズ除去(Denoising)をやってみた件

R Deep Learning R - Keras R - TensorFlow DL - Autoencoder グラフ可視化画像データノイズ除去

「R/Keras/TensorFlowでやるディープラーニングのすゝめ」の連載２回目です。【１】では、ベクトルデータに対する Autoencoderを取り上げたが、今回は、 2D Convolutional Neural Network (CNN: 畳み込みニューラルネットワーク) を使ったAutoencoderの実…

R/Keras/TensorFlowでやる『ディープラーニング(Deep Learning)』のすゝめ【その１】教師なしニューラルネットワークDeep Autoencoder のsimple modelをやってみた件

R R - Keras R - TensorFlow Deep Learning DL - Autoencoder グラフ可視化

Rで、ディープラーニング( Deep Learning )をやるというのが最近の活動である。【１】では、教師なしニューラルネットワークであるAutoencoder（オートエンコーダー）のsimple modelを実装してみる。 Autoencoder は、Encoder（元データから低次元への変換…