Mac - PyMOL
M1 Mac
R言語
ケモインフォ
情報化学
PubChem
NCBI - PubChem
Open-Babel
Mac - PyMOL
PDB形式
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mol2形式
R - readr
Homebrew - ImageMagick
画像結合
Homebrew
はじめに 実行環境 Rパッケージの読み込み Open-Babel & PyMolのインストールについて Open-Babelの基本動作 Open-Babelの関連コマンドについて PubChemからの化合物の情報・構造データの取得 Rで、PubChem化合物データを読み込み 「gluc」あるいは「glyc」…
M1 Mac
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ドッキング
Docking
ドッキング・シミュレーション
分子シミュレーション
AutoDock
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Terminalコマンド - wget
Terminalコマンド - chmod
brew - boost
LigPlot+
Mac - PyMOL
brew - pymol
mov-gif
ケモインフォ
はじめに - AutoDock Vina 原著論文 - AutoDock Vina - 今回やること セットアップ brewの設定 brewコマンドを用いたパッケージのセットアップ Autodock Vina 1.2.2のセットアップ AutoDock Vinaのチュートリアル「basic_docking」を実行してみる 実行時のコ…
PyMOLは、オープンソースの分子グラフィックスツールである。 いまも、教育版(Educational-use-only PyMOL)は、以下のフォームで登録すれば、フリーで使用できるらしい。 pymol.org 少し前にまとめた資料であるが、PyMolコマンドのメモとしてアップしてお…