京橋のバイオインフォマティシャンの日常

南国のビーチパラソルの下で、Rプログラムを打ってる日常を求めて、、

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Terminalコマンド - mkdir

バーチャルスライドスキャナー画像（.ndpi）からオリジナルTIFFイメージを取り出す際のTips〜ギガバイトイメージの画像解析入門〜

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はじめに 今回、バーチャルスライドスキャナー画像（.ndpi）の取り扱い方を取り上げる。 .ndpiという画像フォーマットは、浜松ホトニクス社が提供するHamamatsu formatの１つである。 NDPIファイルは「独自メタデータを持つシングルファイルTIFF-likeな形式…

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grepコマンド で基本的なテキスト処理をまとめてみた件

Mac Terminalコマンド テキスト処理 Terminalコマンド - grep Terminalコマンド - which Terminalコマンド - mkdir Terminalコマンド - wget grepで文字列処理

はじめに grep コマンドは、AppleのHPにファイル内の文字列を探すツールであると説明されているが、 grep コマンドを知ると、単に「文字列を探す」だけでなく、 いろいろな応用的な操作ができるようになる。 この記事では、Mac版 grepコマンド の基本的なテ…