M1チップ搭載の MacBook Air におけるAutoDock Vina (1.2.2) の諸設定とドッキングシミュレーションについて

M1 Mac Mac ドッキング Docking ドッキング・シミュレーション分子シミュレーション AutoDock AutoDock Vina Terminalコマンド - wget Terminalコマンド - chmod brew - boost LigPlot+ Mac - PyMOL brew - pymol mov-gif

はじめに - AutoDock Vina 原著論文 - AutoDock Vina - 今回やることセットアップ brewの設定 brewコマンドを用いたパッケージのセットアップ Autodock Vina 1.2.2のセットアップ AutoDock Vinaのチュートリアル「basic_docking」を実行してみる実行時のコ…

AutoDock Vina ドッキングシミュレーション結合モデル

2022-01-25

grepコマンドで文字列処理をやってみた件【その１】ファイル内のテキストに対する処理とか

Mac Terminalコマンドテキスト処理 Terminalコマンド - grep Terminalコマンド - svn Terminalコマンド - cat Terminalコマンド - wc Terminalコマンド - du Terminal - ショートカット Terminalコマンド - head Terminalコマンド - tail Terminalコマンド - shutdown Terminalコマンド - chmod grepで文字列処理

はじめに練習用のファイルのダウンロードファイル内のテキストに対する処理ある特定の文字列を含む行を表示するある特定の文字列を含まない行を表示するある特定の文字列を含まない行を別ファイルに出力する空白行を削除するファイル内の行数をカウン…

文字列処理 grep

2021-08-05

【LINUX/Macの基本コマンド④】cd, cat, head/tailなどのコマンドの使い方メモ

Terminalコマンド - cd Terminalコマンド - cat Terminalコマンド - head Terminalコマンド - tail Terminalコマンド - history Terminalコマンド - reboot Terminalコマンド - jobs Terminalコマンド - chmod Terminalコマンド - shutdown LINUX/Macの基本コマンド LINUX - コマンド入門 LINUX

はじめに cd : ディレクトリ移動 cat : ファイル内表示・結合・作成 head / tail : ファイルの先頭や末尾を表示覚えておくと良いターミナルコマンドターミナルコマンド補足編まとめ LINUX/Macの基本コマンドの関連記事はじめにターミナル上で、よく使う…

linux コマンド基本コマンド基本 cd linux コマンド mac tail linux tail head mac コマンドターミナル mac 初心者向け macos コマンド mac linux コマンド

2021-02-21

Mac Dockerインストール後に、docker-compose のバージョンを「1.27.4」から「1.28.4」にアップグレードさせるTips

Docker Docker-compose Terminalコマンド - chmod Terminalコマンド - mv Terminalコマンド - wget Mac - Docker

はじめに docker-compose 1.28.4 をGitHubリポジトリからダウンロード・インストール【追記 2021/4/13】Mac docker-compose 1.26.2 を 1.27.4 にアップグレードするまとめはじめに Dockerインストール後に、docker-compose のバージョンが合わないという…

docker インストール mac docker ダウンロード mac docker-compose バージョン変更 docker compose インストール docker compose インストール mac

2020-10-12

バーチャルスライドスキャナー画像（.ndpi）からオリジナルTIFFイメージを取り出す際のTips〜ギガバイトイメージの画像解析入門〜

バーチャルスライド画像 Mac 画像解析 - Fiji/ImageJ 画像解析 - NDPITools Terminalコマンド - ndpisplit Terminalコマンド - wget Terminalコマンド - which Terminalコマンド - chmod Terminalコマンド - open Terminalコマンド - mkdir Terminalコマンド - mv Terminalコマンド - cd

はじめに NDPIToolsのセットアップ NDPIテストファイルのダウンロード ndpisplitコマンドを用いたNDPIファイルの展開 Fiji/ImageJでのCompress TIFFのインポート&エクスポート ImageJマクロでの実行まとめ ImageJ & 画像解析に関する入門書補足 Fiji/Image…