京橋のバイオインフォマティシャンの日常

まずは、データ分析、コマンドラインのメモとして

2021-02-21から1日間の記事一覧

Macターミナル・コマンドのショートカットメモ

(削除) ショートカットキー 1文字の削除 DeleteCtrl (Control) + h 1単語の削除 Ctrl + w カーソル位置から行頭まで削除 Ctrl + u カーソル位置から行末まで削除 Ctrl + k カーソル上の1文字削除 Ctrl + d (履歴) ショートカットキー 一つ前のコマンド…

Mac brew で、pythonの古いバージョンを管理するときのTips 〜「python3」から「python」にコマンド名を書き換える〜

pythonの古いバージョン(例えば、3.8とか)をインストールしたいとき、 パッケージのlinkをしないと、それが使えなくなっている。 今回、python3.8をbrewでインストールして、パッケージのlinkをやり直して、 コマンド名を「python」に書き換えるまでをやっ…

Dockerインストール後に、docker-compose のバージョンを「1.27.4」から「1.28.4」にアップグレードさせるTips

Dockerインストール後に、docker-compose のバージョンが合わないということがある。 今回、「1.27.4」から「1.28.4」にアップグレードさせる実行例を取り上げる。 #Docker のインストール $ brew install --cask docker #Docker.appの起動 $ open /Applicat…

【R・ビッグデータ解析の処方箋①】readLines、connection オブジェクトを使って、テキストファイルの1行ずつ読み込みを実行してみた件〜

現状、数十GB・数百GBといった、大きなファイルを扱う際には、R/メモリ上で全データを読み込むことはややリスキーである。 ファイル全体を読み込まず、ファイル内の1行ずつで処理を実施する工夫が必要となる。*1 Rで、1行ずつの処理を実行するには、readLi…

Mac版 JAVAバージョン切り替えメモ : Java 14 から 12 への切り替え

Mac PC内に、Java 14 と 12 が混在している状況で、Java 14 からJava 12にパスを切り替えるメモ書き。 #現在のJava パス $ which java /usr/bin/java # Javaのバージョン確認 => java 14 が使用されている $ java -version java version "14" 2020-03-17 Jav…