京橋のバイオインフォマティシャンの日常

まずは、データ分析、コマンドラインのメモとして

R - Google search

R/Slack APIの諸設定、slackrの使い方、及びGoogle scholarで検索された新着論文情報を知らせるTips

RのSlack APIであるslackrパッケージの使い方について、いろいろとまとめてみた*1。 APIの諸設定、基本的なslackrの使い方に加えて、新着論文情報をRからチャネルに送信するプログラムも実装してみた。 まずは、Salck API設定の手順からはじめよう。 Salck A…

R言語/Webスクレイピングで、Google サーチ / Google scholar経由で見つかったPDFファイルを自動ダウンロードしてみた件

Webスクレイピングとは、Webサイトから情報を抽出して、その情報を格納・分析可能な構造化データへと変換する技術を意味するようだ*1。 本記事では、RからWebスクレイピングで、 キーワード検索してヒットしたURLやPDFファイルを自動取得する方法を紹介しま…