京橋のバイオインフォマティシャンの日常

南国のビーチパラソルの下で、Rプログラムを打ってる日常を求めて、、

AutoDock Vina

M1チップ搭載の MacBook Air におけるAutoDock Vina (1.2.2) の諸設定とドッキングシミュレーションについて

はじめに - AutoDock Vina AutoDockは、 30年近く開発が進められている、分子モデリングシミュレーションソフトウェアの一つです。 主に、タンパク質–リガンドのドッキングに利用されています。 2009年からオープンソース・ソフトウェアとなり、非商業的利用…

分子モデリングシミュレーションソフトウェア AutoDock関連資料のまとめ

過去に作成した、Autodock関係の説明資料(AutoDock、AutoDock Vina、Raccoon、Ligplot+)をこちらにもまとめてみた。 AutoDock AutoDock_japanese_ver.1.0 AutoDock_japanese_ver.1.0 from Satoshi Kume Autodock Vina AutoDock_vina_japanese_ver.3.0 Auto…