京橋のバイオインフォマティシャンの日常

南国のビーチパラソルの下で、Rプログラムを打ってる日常を求めて、、Daily Life of Bioinformatician in Kyobashi of Osaka

データ読み込み

【Rのジミ〜な小技シリーズ】エクセルデータをクリップボードにコピーして、Rのread.table関数でデータフレームとして読み込むTips

エクセルデータをクリップボードにコピーしてR環境に読み込む コピーしたセルがヘッダーを含む場合 コピーしたセルがヘッダーを含まない場合 追記(2020年6月10日): マークダウンなどでテーブル出力 【Rのジミ〜な小技シリーズ】 参考資料 エクセルデータを…

【R・ビッグデータ解析の処方箋①】readLines、connection オブジェクトを使って、テキストファイルの1行ずつ読み込みを実行してみた件〜

はじめに 練習ファイルのダウンロード readLinesのダメな実行例 readLinesの実行コード例 まとめ R・ビッグデータ解析の処方箋 関連記事 R言語 お勧め書籍 補足 readLines関数で、10万行の同時読み込み 参考資料 はじめに 現状、数十GB・数百GBといった、…

【R言語】データサイズ・行数が異なるテキストファイルにおけるファイル読み込み関数の速度比較

はじめに 実行環境 検証用のファイル生成 opensslコマンドを用いた、ランダム文字列の生成 echoとtrコマンドを用いた文字列の生成 seqコマンドを用いた連番数字の生成 seqコマンドを用いた検証用ファイルの生成 Rでのファイル読み込み検証 utils::read.table…