ケモインフォ
M1 Mac
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情報化学
PubChem
NCBI - PubChem
Open-Babel
Mac - PyMOL
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Homebrew - ImageMagick
画像結合
Homebrew
はじめに 実行環境 Rパッケージの読み込み Open-Babel & PyMolのインストールについて Open-Babelの基本動作 Open-Babelの関連コマンドについて PubChemからの化合物の情報・構造データの取得 Rで、PubChem化合物データを読み込み 「gluc」あるいは「glyc」…
M1 Mac
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ドッキング
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ドッキング・シミュレーション
分子シミュレーション
AutoDock
AutoDock Vina
Terminalコマンド - wget
Terminalコマンド - chmod
brew - boost
LigPlot+
Mac - PyMOL
brew - pymol
mov-gif
ケモインフォ
はじめに - AutoDock Vina 原著論文 - AutoDock Vina - 今回やること セットアップ brewの設定 brewコマンドを用いたパッケージのセットアップ Autodock Vina 1.2.2のセットアップ AutoDock Vinaのチュートリアル「basic_docking」を実行してみる 実行時のコ…
過去に作成した、Autodock関係の説明資料(AutoDock、AutoDock Vina、Raccoon、Ligplot+)をこちらにもまとめてみた。 AutoDock AutoDock_japanese_ver.1.0 AutoDock_japanese_ver.1.0 from Satoshi Kume Autodock Vina AutoDock_vina_japanese_ver.3.0 Auto…