ShortRead
Mac
R言語
Bioconductor
R - Bioconductor
FASTQ形式
ShortRead
ShortRead - readFastq
SRA Toolkit
fastq-dump
シークエンスデータの取得
シークエンスデータ解析
R - バイオインフォ
FASTQファイル
R - par()
はじめに 今回は、MacOSX環境で、SRA Toolkitのfastq-dumpを用いて取得した、 FASTQ形式ファイルをRに読み込む方法を扱う。 FASTQ形式ファイルの読み込みには、 Bioconductorパッケージの1つである、 ShortReadパッケージのreadFastq関数を用いる。 readFast…