はじめに
現在（2021年4月）、CentOS7のepelリポジトリからインストールできるRバージョンは、「R-3.6.0-1.el7.x86_64」です。
「R-4.x」シリーズをインストールするために、、、いろいろと試して、結局、、、 springdaleのリポジトリではなくて、 CRANにあるソースファイルからコンパイルするのが一番良さそうでした。
また、CentOS版 Rstudio-server のRバージョンも「R-3.6.0」から「R-4.x」に変更しました。
今回、実行した手順をメモしておきます。
まずは、ターミナルを起動して、epel版Rとかを消します。
Rの削除
#epel版R の削除 sudo yum remove --enablerepo=epel -y R #/usr/binにある関連ファイルを探して削除する ls /usr/bin | grep "R" #削除 sudo rm -rf /usr/bin/R sudo rm -rf /usr/bin/Rscript #ホームディレクトリにRフォルダがあれば、削除しておく #cd #rm -rf R
Rのパスを確認すると、no R が表示されます。
$ which R /usr/bin/which: no R in (...)
R-4のダウンロード & コンパイル
最新版である、R-4.0.5をダウンロードすします。
#CRANからのダウンロード wget https://cran.r-project.org/src/base/R-4/R-4.0.5.tar.gz #解凍 tar -zxvf R-4.0.5.tar.gz #不要なファイルを削除 #rm -rf R-4.0.5.tar.gz #Rディレクトリ内に移動 cd R-4.0.5 #コンパイル実行 sudo ./configure #OR #sudo ./configure --enable-R-shlib #--enable-R-shlibを設定すると、結構時間がかかる #--prefix: インストール先を指定できる。ex. --prefix=~/R #make 実行（以下を順番に実行する、5-10分くらいかかる） sudo make sudo make check sudo make install
上記の実行が完了すれば、Rのパスとバージョンを確認します。
which R #/usr/local/bin/R R --version #WARNING: ignoring environment value of R_HOME #R version 4.0.5 (2021-03-31) -- "Shake and Throw" #Copyright (C) 2021 The R Foundation for Statistical Computing #Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) # #R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY. #You are welcome to redistribute it under the terms of the #GNU General Public License versions 2 or 3. #For more information about these matters see #https://www.gnu.org/licenses/. #いちおう、不要なフォルダの削除 #cd ../ #sudo rm - rf R-4.0.5
Rstudio-server で、Rパスを確認する方法
R-4.0のインストール後に、一度、再起動することをお勧めします。
そうすると、Rstudio-server での設定が勝手に変わっているはずです。
sudo rstudio-server restartだけでは、うまく設定が反映されなかったです。。
Rstudio-serverにアクセスして、コンソールに以下が表示されて、 Rパスやライブラリパスが変更されていたら、OKです。
#ログイン時 #R version 4.0.5 (2021-03-31) -- "Shake and Throw" #Copyright (C) 2021 The R Foundation for Statistical Computing #Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) system("which R") #/usr/local/bin/R system("R --version") #R version 4.0.5 (2021-03-31) -- "Shake and Throw" #Copyright (C) 2021 The R Foundation for Statistical Computing #Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) # #R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY. #You are welcome to redistribute it under the terms of the #GNU General Public License versions 2 or 3. #For more information about these matters see #https://www.gnu.org/licenses/. .libPaths() #[1] "/home/[Host name]/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.0" #[2] "/usr/local/lib64/R/library"
補足
今回、r-libs-user、rsession-which-rとかの設定は、特に不要だった。。
