最近、CentOS7に、R-4.1.0をインストールしたので、その際のメモを残しておく。
まずは、古いバージョンのRを消す
#とりあえず、yumで削除する sudo yum remove R #あと、sudo rmも使って、不要なバージョンを削除する、、 #Rパスを確認する which R #/usr/bin/which: no R in (/usr/lib64/qt-3.3/bin:/home/rch/perl5/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/ #usr/local/sbin:/usr/sbin:/usr/local/cuda-9.0/bin:/usr/local/cuda-9.0/lib64:/usr/local/cuda #-9.0/bin:/usr/lib/python2.7/site-packages/:/home/sas/.local/bin:/home/rch/.local/bin:/home/rch/bin) #というように、表示されればOK
R-4.1.0 のダウンロード & コンパイル
現在の最新版あたりである、R-4.1.0 (2021-05-18 09:05) をダウンロードして、コンパイルする。
いま、一番最新は、R-4.1.2であるが、普段使いのPCにはまだ怖くて入れられない。。。
#CRANからのダウンロード wget https://cran.r-project.org/src/base/R-4/R-4.1.0.tar.gz #解凍 tar -zxvf R-4.1.0.tar.gz #のちほど、不要なファイルを削除 #sudo rm -rf R-4.1.0.tar.gz #Rディレクトリ内に移動 cd R-4.1.0 #コンパイル実行 sudo ./configure --enable-R-shlib #--enable-R-shlibを設定すると、結構時間がかかる #--prefix: インストール先を指定できる。ex. --prefix=~/R #make 実行（以下を順番に実行する、5-10分くらいかかる） sudo make sudo make check sudo make install
上記の実行が完了すれば、Rのパスとバージョンを確認しておく。
which R #/usr/local/bin/R #バージョンを確認する R --version #R version 4.1.0 (2021-05-18) -- "Camp Pontanezen" #Copyright (C) 2021 The R Foundation for Statistical Computing #Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) # #R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY. #You are welcome to redistribute it under the terms of the #GNU General Public License versions 2 or 3. #For more information about these matters see #https://www.gnu.org/licenses/.
上記のR実行で、
-bash: /usr/bin/R: そのようなファイルやディレクトリはありません
というエラーが出たら、、、
エラーの場合、/usr/binにもシンボリックリンクを追加する
/usr/binにもシンボリックリンクを追加してみる。
#シンボリックリンクの追加
sudo ln /usr/local/bin/R /usr/bin
そして、Rが起動できて、以下のように表示さされば、インストールは完了である。
R version 4.1.0 (2021-05-18) -- "Camp Pontanezen" Copyright (C) 2021 The R Foundation for Statistical Computing Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) R は、自由なソフトウェアであり、「完全に無保証」です。 一定の条件に従えば、自由にこれを再配布することができます。 配布条件の詳細に関しては、'license()' あるいは 'licence()' と入力してください。 R は多くの貢献者による共同プロジェクトです。 詳しくは 'contributors()' と入力してください。 また、R や R のパッケージを出版物で引用する際の形式については 'citation()' と入力してください。 'demo()' と入力すればデモをみることができます。 'help()' とすればオンラインヘルプが出ます。 'help.start()' で HTML ブラウザによるヘルプがみられます。 'q()' と入力すれば R を終了します。
configure実行時の補足
configure: WARNING: neither inconsolata.sty nor zi4.sty found: PDF vignettes and package manuals will not be rendered optimally
というエラーが出たとしても、無視かな。。。
